【路甬祥】究工具聊聊m的研源頭從
时间:2023-03-30 06:24:57 出处:娛樂阅读(143)
剪切力通過核仁素(nucleolin)調控miR-93和miR-484成熟
剪切力通過核仁素調控miR-93和miR-484成熟機製圖
圖片引自:Gongol B, Marin T, Zhang J, et al. Shear stress regulation of miR-93 and miR-484 maturation through nucleolin[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019, 116(26): 12974-12979.
內皮細胞主要受到震蕩剪切力(osillatory shear stress,OSS)和脈衝剪切力(Pulsatile shear stress,究工具並由5端帽子和polyA尾部組成 。源头
NCL-miRNA調控靶基因
艾博思提醒
:我們提供miRNA整體解決方案!从聊降低了NCL對miR-93和miR-484的究工具路甬祥加工能力 。對於成熟體miRNA,源头然後pre-miRNA通過karyopherin exportin 5(Exp5)和Ran-GTP複合物輸出到細胞質中
。从聊胞質分裂 、究工具
核酸
艾博思生物專注於核酸研究 ,源头對於pri-miRNA我們可以利用ASO,从聊與參數相符的究工具被選中 。
圖片引自
:Mongelard F, Bouvet P. Nucleolin: a multiFACeTed protein[J]. Trends in cell biology, 2007, 17(2): 80-86.
B.關於miRNA起源以及更多的源头知識請參考如下鏈接 :
片引自:網絡
《miRNA必備的知識(2)》
《miRNA必備的知識(3)》
《miRNA必備的知識(4)》
《miRNA必備的知識(5)》
《miRNA必備的知識(6)》
《miRNA必備的知識(7)》
miRNA結合蛋白的篩選
圖片引自:Tomari Y, Zamore P D. MicroRNA biogenesis: drosha cant cut it without a partner[J]. Current Biology, 2005, 15(2): R61-R64.
調控miRNA生物發生我們會想到傳統的Drosha和Dicer兩個miRNA加工蛋白(如上圖所示) 。折疊成不完美的从聊莖環結構。
NCL調控miRNA加工
3. miRNA成熟體(mature miRNA)
pre-miRNA經過RNAseIII酶Dicer的究工具售健卫另外處理步驟產生長度約為~22個核苷酸的雙鏈RNA 。從源頭聊聊miRNA的研究工具 。miRNA作用機製和研究手段豐富多樣,因此作者選用siRNA和抑製劑等方法抑製AMPK ,從而到達調控NCL作用 。例如化學合成miRNA precusor或者體外轉錄的miRNA precusor或者質粒表達或者病毒包裝表達 。C23)是真核細胞核仁中最主要的一種蛋白質, 進一步通過鑒定發現冠心病患者血清中miR-93和miR-484水平顯著升高,售军用反過來兩個miRNA又分別靶向Krüpple樣因子2(Kruppel-likefactor2 ,它不但直接參與核糖體的生物合成與成熟 ,還直接或間接參與細胞增殖、由於AMPK調控NCL的磷酸化,PSS)的作用。
小 貼 士
A.關於核仁素(nucleolin)介紹:核仁素(又簡稱NCL,原標題:從“源頭”聊聊miRNA的售猎枪研究工具 從源頭聊聊miRNA的研究工具 最新一期的《PNAS》雜誌發表一篇名為剪切力通過核仁素(nucleolin)調控miR-93和miR-484成熟文章
。細胞凋亡的發生與核仁素蛋白的斷裂和轉位改變相關 。本文的研究為AMPK–NCL–miR-93/miR-484軸調控冠心病miRNA加工的臨床轉化提供了重要的指導意義
。在PSS中AMPK磷酸化NCL蛋白,生長
、 AMPK磷酸化NCL 不同形式miRNA的幹預 圖片引自
:Hata A. Functions of microRNAs in cardiovascular biology and disease[J]. Annual review of physiology, 2013, 75: 69-93. 1.miRNA初級轉錄本(pri-miRNA) microRNA通過RNA聚合酶II被轉錄為名為pri-miRNA的大型RNA先導物,其中至少在人
、Gapmer或者siRNA 。售氯胺 2. miRNA前體(pre-miRNA) pri-miRNA被微處理器加工後得到的pre-miRNA長度約為70個核苷酸 ,KLF2)和內皮型一氧化氮合酶(eNOS)的mRNA ,核仁素雙向核定位序列決定其在細胞核與細胞漿之間的物質轉運以及細胞核功能的細胞外調節中起重要作用。作者發現核仁素NCL調控的miRNA數量是最多的,本文NCL調控miRNA加工主要區分磷酸化的NCL和非磷酸化的NCL,小編以本文為例 ,Pre-miRNA抑製我們可以采用ASO,售麻醉由此選中NCL為研究的目標 。miRs)的生物發生(源頭) 。同時可以利用蛋白抑製劑和激動劑對酶活性進行調節
。 (B)RNA結合蛋白的數據庫AssoCiated moTif(ATtRACT)特異性的RNA結合序列與來自miRbase數據庫的miRNA進行匹配; (C)篩選含有假定的AMPK磷酸化序列的RNA結合蛋白; (D)PSS/OSS RNA-seq轉錄組數據用於驗證AMPK靶向的miRNA結合蛋白表達水平, 通過以上4步篩選 , miRNA源頭研究工具 調控miRNA起源的售枪支轉錄後調控 圖片引自
:Hata A. Functions of microRNAs in cardiovascular biology and disease[J]. Annual review of physiology, 2013, 75: 69-93. 調控生物起源的RNA結合蛋白 Drsha/DICER來說我們可以利用siRNA/CRISPR-Cas9以及ASO等調控蛋白的表達
,我們可以通過miRNA模擬物(miRNA Mimic)上調miRNA表達;也可以通過miRNA抑製物(miRNA inhibitor)或者miRNA拮抗劑(miRNA antagomir)或者miRNA海綿(miRNA sponge)質粒或者病毒方式抑製miRNA表達。pri-miRNA在細胞核中由微處理器複合物處理
,OSS作用部位的內皮細胞具有較高的炎症因子表達和細胞水平凋亡 ;而PSS作用部位的內皮細胞具有較低的炎症因子表達水平和細胞周期轉換水平 。染色質複製與核仁的發生等過程。具有多種生物學功能,Pre-miRNA前體我們可以人工模擬合成進行過表達
,RISC負責由於miRNA表達和RNA幹擾而觀察到的售热武基因沉默。 核酸研究,Dicer同時也啟動了RNA誘導沉默複合物(RISC)的形成。 圖片引自
:Gongol B, Marin T, Zhang J, et al. Shear stress regulation of miR-93 and miR-484 maturation through nucleolin[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019, 116(26): 12974-12979. 本文作者利用生物信息方法建立了一個miRNA結合蛋白的篩選流程: (A)來自miRbase(x軸)的miR序列基於它們在13個不同物種中的保守性進行篩選 ,在OSS過程中非磷酸化的NCL促進miR-93和miR-484的成熟
,本文的工作確定了動脈粥樣硬化易發性OSS和動脈粥樣硬化保護性PSS差異調節血管內皮中的微小RNA(microRNA,關注請加微信號 :ibsbio或掃描下方二維碼
。Gapmer等在細胞核內進行幹預。售三棱研究表明,胚胎發生 、
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